En estos textos y sobre el transfondo de una época marcada por luchas sangrantes y dogmatismo, Locke propone la radical separación entre Estado e Iglesia. El primero debe procurar por la preservación del bienestar de los ciudadanos, la segunda ha de dedicarse al cuidado de las almas. Cualquier interferencia entre ambos poderes causará desastres, por este motivo Locke exige al poder político tolerancia en materia de religión.